[kaczakat]

W podanym przez Ciebie linku jest zakładka learn a tam instrukcja i code Arduino (w Guide jest komplet).  Jak napisał azbest22 procek można wyjąć i zaprogramować w UNO. Można też wykorzystać przejściówkę FTDI, ona ma komplet wyprowadzeń:
- GND
- CTS
- VCC
- TX0
- RX1
- DTR
Zwykle TX/RX się krosuje, czasami jednak opis może być mylny i oznaczać "tu to podłącz" (czyli TX-TX) z zewnętrznego urządzenia, dlatego najlepiej zajrzeć do instrukcji/podłączyć jakiś analizator logiczny typu Salae.
Po podłączeniu FTDI (np. takiej, można ją ustawić na 3,3V http://allegro.pl/konwerter-usb-rs232-ua...71287.html  ), programujesz jak zwykłe arduino podając port COM FTDI. Zgaduję, że ten zegarek jest stworzony do podanego przeze mnie konwertera FTDI, bo układ pinów jest dokładnie jak na niej ze skrosowaniem TX/RX - po prostu wtykasz, dociskasz na czas programowania i gotowe. 
Najważniejsze, z kodu programu wynika, że gdy czas jest wyświetlany naciskasz ponownie przycisk >2s i ustawiasz czas, nie ma opcji ustawiania przez UART - ale może dorobisz sobie. Nie ma więc potrzeby podłączania do arduino czy do PC przez przejściówkę, chyba że chcesz sobie coś zmienić w kodzie.